广州逆转录
RT-PCR就是逆转录PCR或称为反转录PCR(Reversetranscription-PCR,RT-PCR),是以RNA为材料应用于PCR扩增中的一种实验方法。首先通过逆转录酶将总RNA或信使RNA(mRNA)转录成互补DNA(cDNA)。其次TaqDNA聚合酶以cDNA为模板进行qPCR扩增。RT-PCR已被普遍应用于多种分子生物学应用中,包括基因表达分析、基因测试、RNA干扰验证检测、微阵列验证、病原体检测和疾病研究。RT-PCR的方法之一步法和两步法:RT-PCR其操作方法分为两种,即一步法和两步法。一步法RT-PCR,逆转录同PCR扩增结合在一起,即cDNA合成与PCR扩增反应在同一管Buffer及酶中进行,一步完成。两步法RT-PCR,RNA首先在反转录酶的作用下生成cDNA,再以cDNA为模板进行PCR扩增,分成两步进行。逆转录实验前要对反应体系进行无RNA和无反转录酶的对照。广州逆转录
逆转录是指以RNA为模板合成DNA的过程,即将遗传信息由RNA逆向传给DNA的过程,其遗传的传递方向与转录相反。反转录酶也可写成逆转录酶又称为依赖RNA的DNA聚合酶。是以RNA为模板指导三磷酸脱氧核苷酸合成互补DNA(cDNA)的酶。哺乳类C型病毒的反转录酶和鼠类B型病毒的反转录酶都是一条多肽链。鸟类RNA病毒的反转录酶则由两上亚基结构。真核生物中也都分离出具有不同结构的反转录酶。RNA指导的DNA聚合酶活性;以RNA为模板,催化dNTP聚合成DNA的过程。此酶需要RNA为引物,多为色氨酸的tRNA,在引物tRNA3′-末端以5′→3′方向合成DNA。反转录酶中不具有3′→5′外切酶活性,因此没有校正功能,所以由反转录酶催化合成的DNA出错率比较高。北京一步法逆转录混合逆转录的目的是将RNA变为DNA,便于PCR扩增。
逆转录的过程:生物体中的逆转录过程就比较复杂,比如逆转录病毒(retrovirus)。病毒是真正的“极简风”,所有东西都压缩到非常。比如它的基因组中,经常有些基因是重叠、嵌套结构,充分利用每一个碱基。所以它也不会专门编码一个引发酶来合成引物,它一般是在组装时带走宿主的tRNA,在下次侵染时当作引物使用。被用作引物的tRNA会结合在病毒基因组RNA链的中间,所以首先次只能合成出一部分cDNA,然后利用基因组RNA两端的一段重复序列,“跳”回另一端,完成整条链的逆转录。之后水解RNA链的时候,会留下一些片段作为复制的引物。双链DNA的合成同样也需要经过一次跳跃(jump),以合成完整双链。较后两端具有相同的序列,称为长末端重复(longterminalrepeats,LTR)。LTR不只包含跳跃时用来配对的序列,还有整合信号、启动子、增强子、polyA位点等重要结构。
逆转录实验步骤:引物浓度计算方法:(新合成的引物的稀释)假如终浓度为XuM(pmol/ul)加DEPC水体积(ul)=(OD×33×1000000)/(分子量×X)。用AMV逆转录酶进行RT(10ul体积)1、准备0.65mlEP管。2、加入4.5ulDEPC水,1ul引物,1ul模板RNA。3、稍离心,100℃沸水裕1min。4、加入0.5uldNTP,2ul5×Buffer,1ulAMV逆转录酶。5、稍离心,封口膜封口,42℃水浴90℃作RT。6、100℃沸水裕3min灭活AMV。7、立即PCR或-20℃保存。逆转录实验时注意事项:为避免RNA酶污染,在RT中仍要佩戴一次性手套和口罩。逆转录是以RNA为模板合成DNA的过程,即RNA指导下的DNA合成。
逆转录常见问题及解决方法之RNA浓度不高:a)、原始组织样本或细胞量太少:提高加入量。b)、RNA发生降解:如果使用者确定提取RNA的试剂/器具没有问题,RNA的降解通常发生在样品破碎/匀浆阶段。有两个办法可以彻底抑制内源RNase活性:1.立即加入裂解液并且彻底而迅速地匀浆。这只适合培养细胞及内源RNase含量较低的并且较容易匀浆的组织,2.对于内源RNase含量高或不易匀浆的组织,如肝脏、胰腺、脾脏、肌肉等,或植物组织,需要切成小块后立即投入液氮冷冻,再按说明进行破碎/匀浆。c)、加入异丙醇后室温沉淀10min或-20C冰沉淀30min即可,无需过夜沉淀。逆转录实验前应反复检查所有试剂盒的有效期和使用条件。广州逆转录
质粒RNA检测中的逆转录反应需要特定反应体系。广州逆转录
逆转录试剂在许多生物学和医学领域中都有普遍的应用。例如,在病毒学研究中,逆转录试剂可以被用来检测病毒RNA的存在和浓度。此外,在基因表达和基因调控的研究中,逆转录试剂也可以用来研究mRNA的表达模式和在细胞内的分布状态。虽然逆转录试剂在研究中发挥着重要的作用,但研究人员在选择试剂时需要考虑多种因素。例如,试剂的纯度、稳定性和活性都会影响实验结果的准确性和可重复性。此外,试剂的价格和供货渠道也是研究人员需要考虑的因素之一。广州逆转录
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