广州一体化逆转录测序

时间:2023年06月21日 来源:

逆转录实验步骤:用SSⅢ逆转录酶进行RT(20ul体积)1、准备0、65ml的EP管。2、冰上操作:在EP管中加入10ulDEPC水,1ul引物,1ul模板RNA,1uldNTP,短暂离心。3、65℃水浴5分钟后,立刻0℃冰水浴至少1分钟。4、短暂离心后,冰上操作:加入4ul5×First-StrandBuffer,1ul0.1MDTT,1ulRNAseInhibitor,1ulSSⅢ逆转录酶。5、短暂离心。6、50℃水浴60分钟进行逆转录。7、70℃水浴15分钟灭活逆转录酶。8、-20℃保存,或立即进行PCR。MCERTmix含有比例优化的Oligo(dT)和RandomPrimers,使cDNA合成可从RNA转录本的各个区域起始,并具有相同的逆转录效率,较大程度保证qPCR结果的真实性和可重复性。质粒RNA检测中的逆转录反应需要特定反应体系。广州一体化逆转录测序

反转录酶的注意事项,在进行RT反应之前,应考虑以下几个方面:RNA:成功的cDNA合成来自高质量的RNA,高质量的RNA至少应保证全长并且不含逆转录酶的抑制剂,如EDTA或SDS。在提取RNA的过程中,要特别防止RNase的污染,同时在逆转录反应中经常加入RNase抑制剂以增加cDNA合成的长度和产量。RNase抑制剂要在首先链cDNA合成反应中,在缓冲液和还原剂(如DTT)存在的条件下加入,因为cDNA合成前的过程会使抑制剂变性,从而释放结合的可以降解RNA的RNase。蛋白RNase抑制剂只防止RNaseA,B,C对RNA的降解,并不能防止皮肤上的RNase,因此尽管使用了这些抑制剂,也要小心不要从手指上引入RNase,实验过程中经常更换新手套。广州一体化逆转录测序逆转录实验过程中要使用干燥无菌的管头和标本采集器避免受外界污染。

逆转录是指以RNA为模板合成与其互补的cDNA的过程。逆转录PCR是将RNA的逆转录(reversetranscription)和cDNA的聚合酶链式反应(PCR)相结合的技术,故逆转录称为RT-PCR或反转录PCR。逆转录PCR实验原理是,提取组织或细胞中的总RNA,以RNA为模板,利用逆转录酶反转录成cDNA,再以cDNA链为模板进行PCR扩增,从而获得大量拷贝。逆转录PCR的出现使RNA检测的灵敏性提高了几个数量级,使一些极为微量RNA样品分析成为可能。RNA逆转录实验注意事项:选择合适的引物:随机引物法逆转录产生的片段较小,很难得到全长转录本的cDNA。单独选择某一种引物,实验可能都不完美,具体需要根据实验目的来确定。

RT-PCR逆转录中模板的选择:在RT-PCR实验中,选择总RNA或纯化的mRNA作为模板进行逆转录十分重要。mRNA虽然能提供略高的灵敏度,但总RNA经常使用,具有较mRNA更重要的优势。首先,其过程需要较少的纯化流程,这保证了更好的回收模板和更好的把结果标准化为起始的细胞数。第二,避免mRNA富集步骤,为了避免不同mRNA的回收率而带来结果偏移的可能性。总之,在大多数的应用中,目标基因的相对定量比检测的非常灵敏度更重要,因此在多数情况下,总RNA更适用。逆转录实验前应反复检查所有试剂盒的有效期和使用条件。

逆转录酶还有DNA内切酶活性,这可能与病毒基因整合到宿主细胞染色体DNA中有关。逆转录酶的发现对于遗传工程技术起了很大的推动作用,它已成为一种重要的工具酶。用组织细胞提取mRNA并以它为模板,在逆转录酶的作用下,合成出互补的cDNA,由此可构建出cDNA文库(cDNAlibrary),从中筛选特异的目的基因,这是在基因工程技术中较常用的获得目的基因的方法。简要过程表示:逆转录酶的作用是以dNTP为底物,以RNA为模板,tRNA(主要是色氨酸tRNA)为引物,在tRNA3'-末端上,按5'→3'方向,合成一条与RNA模板互补的cDNA单链,它与RNA模板形成RNA-cDNA杂交体。随后又在反转录酶的作用下,水解掉RNA链,再以cDNA为模板合成第二条DNA链。至此,完成由RNA指导的DNA合成过程。病毒复制方式:逆转录病毒(属于RNA病毒):RNA→DNA→RNA。拟逆转录病毒(属于DNA病毒):DNA→RNA→DNA。逆转录实验在反应前应将各反应试剂混匀,避免试剂沉淀或剪切。广州一体化逆转录测序

逆转录实验前应对所有器具和实验台面消毒和清洁,避免交叉污染影响实验结果。广州一体化逆转录测序

逆转录过程由逆转录酶催化,此酶也称依赖RNA的DNA聚合酶(RDDP),即以RNA为模板催化DNA链的合成。合成的DNA链称为与RNA互补DNA(complementaryDNA,cDNA)。逆转录酶在生物界存在于逆转录病毒以及真核细胞(如端粒酶)中,拟逆转录病毒没有单独的逆转录酶,其DNA聚合酶带有逆转录酶的活性,可能与病毒的恶性转化有关。人类免疫缺陷病毒(HIV)就是一种逆转录病毒,含有逆转录酶。在小鼠及人的正常细胞和胚胎细胞中也有逆转录酶,例如端粒酶就是一种逆转录酶,推测可能与细胞分化和胚胎发育有关。广州一体化逆转录测序

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