新疆免疫沉淀CoIP-Western Blot

时间:2024年10月12日 来源:

结合了抗体的磁珠或树脂(Beads)与样本裂解液孵育,通过”抗原-抗体“之间的免疫作用,诱饵蛋白被吸附在Beads上,与此同时,诱饵蛋白的互作蛋白,也一起“共沉淀”到Beads上。洗涤去掉未结合的蛋白后,再用洗脱缓冲液将互作蛋白复合物从Beads上洗脱下来,得到免疫共沉淀(Co-IP)产物。Co-IP产物既可以用WesternBlot检测已知蛋白,也可以用质谱鉴定未知蛋白。当没有合适的诱饵蛋白抗体时,还可以通过表达融合了Flag标签的诱饵蛋白,利用Flag标签抗体做免疫沉淀。即样本过表达Flag-Bait,经裂解后与anti-Flag珠子孵育,诱饵融合蛋白与Beads结合,其互作蛋白“共沉淀”到Beads上,再经洗涤、洗脱后,用WB或质谱检测。Co-IP技术可靠但需注意潜在限制,选特异性抗体、控制条件,多方法验证提升准确性!新疆免疫沉淀CoIP-Western Blot

新疆免疫沉淀CoIP-Western Blot,CoIP

Co-IP技术虽然广泛应用于蛋白质相互作用的研究,但也存在一些局限性。首先,Co-IP技术的结果可能受到抗体特异性的影响。如果抗体与目标蛋白的结合不够特异,可能导致非特异性蛋白的共沉淀,增加背景噪声。其次,Co-IP技术可能无法检测到低丰度的蛋白质相互作用,因为低丰度蛋白在细胞裂解液中的浓度较低,难以形成稳定的复合物。此外,Co-IP技术还受到样品制备和实验条件的影响。样品中的杂质、降解产物或酶活性等因素都可能干扰实验结果。另外,Co-IP技术只能检测到在细胞裂解时存在的蛋白质相互作用,对于瞬时或动态的相互作用可能无法准确捕捉。因此,在使用Co-IP技术时,需要注意这些局限性,并结合其他实验方法和验证手段,以获得更准确的蛋白质相互作用结果。山西相互作用蛋白检测CoIP联合质谱检测Co-IP技术广泛应用于生物医学、药物研发、蛋白质组学等领域,助力科研人员探索生命奥秘!

新疆免疫沉淀CoIP-Western Blot,CoIP

CoIP实验免疫沉淀方法如下:

将25µL(0.25mg)的Pierce蛋白A/G的磁珠加入1.5mL离心管中。

向磁珠中加入175µL免疫沉淀裂解/漂洗缓冲液,轻微涡旋混匀。

将离心管放入磁力架中收集磁珠到离心管的一边。去除上清。

向离心管中加入1mL免疫沉淀裂解/漂洗缓冲液。颠倒离心管数次或轻微涡旋混匀1min。用磁力架收集磁珠。去除上清。

将抗原样品/抗体混合物加入盛有磁珠的离心管中,保持混匀室温下孵育1h。

用磁力架收集磁珠,除去未结合的样品,保存以备分析。

向离心管中加入500µL免疫沉淀裂解/漂洗缓冲液,轻柔混匀。收集磁珠,弃上清。再重复洗两次。

向管中加入500µL超纯水,轻柔混匀。用磁力架收集磁珠,弃上清。

低pH洗脱:向离心管中加入100µL洗脱液。保持混匀在室温下孵育离心管10min。通过磁力分离磁珠,保留含有目的抗原的上清。每100µL洗出液中加入10µL中和液来中和低pH。备选洗脱方法:向离心管中加入100µL1X电泳上样缓冲液,将样品置于加热器中,96-100℃加热10min。通过磁力架分离磁珠,保留含有目的抗原的上清。

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CoIP-Mass和CoIP-WB检测要点:

试验设计:尽量进行试验组别设计和进行生物学重复检测,提高后续验证的阳性率。常规过表达单组(AbIPvsIgGIP);动态互作组学(实验组vs对照组vsIg组)。根据目的设计适当的生物学重复。如果后续以CoIP-Mass数据进行互作组标准分析,则需要3-4组生物学重复;如果后续以寻找关键互作蛋白,进行机制深入研究,则建议1-2次生物学重复。经验显示单次重复假阳性率90%。

蛋白表达和细胞量:细胞用量要求大(2-10e7细胞量),建议不少于5e7(金标准:320g离心细胞量50μl,保障项目用量)。低表达蛋白,建议使用过表达组进行检测。蛋白表达可根据WB结果或初步根据数据库判定(ProteomicsDB;HumanProteinAtlas)。 IP-Mass技术结合免疫沉淀与质谱分析,研究蛋白互作与差异分析,但需注意其局限性与验证!

新疆免疫沉淀CoIP-Western Blot,CoIP

CoIP-Mass和CoIP-WB检测要点:

互作蛋白筛选和验证:数据分析以非标定量信号强度(LFQintensity和FC>10)作为强阳筛选,以文献查阅,功能匹配,批量CoIP-WB验证,提高验证成功率。理想CoIP-MS结果的蛋白定量都到超过1000种蛋白。其中绝大部分蛋白为非特异结合或背景蛋白。以目的蛋白的富集信号强度和差异倍数作为参考(相对强信号和差异),分析实验组中明显定量较高且差异较大的蛋白,作为重要候选蛋白。同时对重要候选蛋白进行STRING互作分析,文献分析,目的蛋白功能匹配分析,选择Top的4-5个蛋白进行CoIP-WB验证,提高CoIP-WB成功率。 免疫共沉淀实验步骤主要包括几个部分。江苏互作蛋白检测CoIP-Western Blot

Co-IP研究蛋白间互作,ChIP研究蛋白与DNA互作,实验原理各具特色!新疆免疫沉淀CoIP-Western Blot

免疫共沉淀与免疫沉淀技术所使用的原理与方法大致相似,所不同的是,在免疫共沉淀中,对靶蛋白的结合与沉淀由另一个与之发生相互作用的蛋白替代。在免疫共沉淀或免疫沉淀的基础上,通过进一步与其它技术的结合,如聚丙烯酰胺凝胶电泳,还可进一步对靶蛋白的的分子量等特性进行鉴定。

免疫沉淀(Immunoprecipitation,IP):利用抗原抗体特异性反应,对某个特定蛋白纯化富集的方法,主要过程包括捕获和固定。(2)免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation,CoIP):CoIP是在IP实验的基础上进行的扩展,主要用于蛋白之间的互作研究,常被用于鉴定特定蛋白复合物的中已知或未知的蛋白组分。其原理是基于抗体与抗原(靶蛋白)之间的特异性结合,此时如果样品溶液中存在能与靶蛋白相互作用的目的蛋白,会一同被拉下来,随后利用SDS-PAGE,WesternBlot等方法对得到的目标蛋白进行分析,进而证明两者间的相互作用。


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