广州流式数字PCR简介

时间:2020年12月04日 来源:

       数字PCR(d PCR)是近年来引起重视并迅速发展起来的一种突破性的核酸定量分析技术。该技术先将核酸模板进行稀释,分配到大量**的反应单元中,使每个反应单元中只有单个模板分子,然后进行PCR扩增反应,扩增结束后对每个反应室的荧光信号进行统计学分析,来定量DNA拷贝数。数字PCR采用先扩增后定量,因此不依赖扩增曲线的循环阈值(Ct),也无需采用内参基因和标准曲线,准确度高、重现性好,可以实现***定量分析。由于其独特的技术优势,已经在临床诊断、转基因成分定量、单细胞基因表达分析、环境微生物检测和下一代测序等研究领域显示出巨大的优势和应用前景。检测数量一次可达96个样品。广州流式数字PCR简介

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       数字PCR采用的策略概括起来非常简单,就是“分而治之”(divide and conquer)[1],这种做法非常类似于计算机科学中的“分治算法”,将一个标准PCR反应分配到大量微小的反应器中,在每个反应器中包含或不包含一个或多个拷贝的目标分子( DNA模板) ,实现“单分子模板PCR扩增”,扩增结束后,通过阳性反应器的数目“数出”目标序列的拷贝数。在实际的数字PCR实验中,事实上是通过呈现两种信号类型的反应器比例和数目进行统计学分析,计算出原始样本中的模板拷贝数。广州微滴式数字PCR代理商全封闭体系,自动化流程操作。

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dPCR的基本原理

       目前dPCR主要有两种形式,芯片式和液滴式,但基本原理都是将大量稀释后的核酸溶液分散至芯片的微反应器或微滴中,每个反应器的核酸模板数少于或者等于1个。这样经过PCR循环之后,有一个核酸分子模板的反应器就会给出荧光信号,没有模板的反应器就没有荧光信号。根据相对比例和反应器的体积,就可以推算出原始溶液的核酸浓度。可以使用几种不同的方法来分配样品,包括微孔板,毛细管,油乳剂和带有核酸结合表面的小型化腔室阵列。样品的分配使人们可以通过假设分子种群遵循泊松分布来估计不同分子的数量,根据泊松分布的原理,反应体系中目标分子的拷贝数可以通过公式A=-ln[(N-X)/N]*N计算,从而解决了多个目标分子存在于单个液滴中的可能性。

二代测序辅助建库

       目前靶向测序建库方法包括扩增子方法,在均相溶液中,当扩增引物增加时,由于扩增引物之间的相互作用,从而影响扩增的效率;如果将其分散到大量微液滴中扩增,将可降低引物间相互作用,提高扩增效率。同时还可以实现对于少量模板的有效扩增,得到更多的有效测序数据。


CRISPR-Cas9基因编辑结果验证

       CRISPR-Cas9技术的发明,是基因编辑技术的一大突破,但如何验证实验是否成功,仍需要高灵敏度的检测方法,数字PCR技术可以满足这一需求。Broad研究所张锋团队发明了以CRISPR为基础的SHERLOCK技术可以对核酸进行高灵敏度的定性检测,但精确定量评估时仍采取了数字PCR进行确认。 FAM、VIC双通道荧光检测。

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相对于二代测序、基因芯片和定量PCR而言,数字PCR具备以下优势:

● 灵敏度可达到单个核酸分子:检测限低至0.001%,主要系为数字PCR可以实现靶标DNA/RNA的生物浓缩;

● 无需标准曲线活参照基因进行对比来测定核算量,可对靶分子起始量进行***定量,直接独处DNA分子的个数;

● 适合环境复杂样品的检测:终点PCR检测,不依赖Ct值,不依赖扩增效率,能克服PCR***剂的影响,避免样品间的交叉***问题,适合各类复杂环境中的样本进行***定量,如动血样、粪便、尿液、痰液、水样、土壤、植物等; 准确的定量结果和优异的重复性。常州流式数字PCR哪家好

20微升体系生成100,000微滴。广州流式数字PCR简介

MicroDrop-100微滴式数字PCR 应用范围如下:

a. 动植物检验检疫,动物源性分析、极微量病原菌检测定量分析、转基因产品检测;

b. 降低筛查成本、缩短检测周期,适用于T13\T18\T21三体综合征等遗传病的风险评估;适用于zhong瘤早期筛查、分子分型、靶向用药和疗效监测等;适用于传染性疾病的早期诊断和诊疗指导;

c. 可用于DNA甲基化的检测、CRISPR-Cas9基因编辑效率检测等。

d.基因表达差异监测单细胞研究:测序、PCR

e.无创产前筛查:低成本、快速、传染性疾病:HBV、HIV、COVID-19 定量 广州流式数字PCR简介

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