华南地区臻准数字PCR生命科学用品

时间:2022年11月30日 来源:

数字PCR技术的出现不是为了完全取代原有分子诊断技术,而是更好的补充和完善现有技术平台。数字PCR为不同应用场景下的多样化核酸检测需求提供了新的思路,尤其是在临床检测方面,在 性疾病早期检测、 疾病的伴随诊断、生殖遗传筛查等领域展现出良好的应用前景。国产数字PCR企业在商业化应用方面,也不断“攻城略地”。新羿生物在检测及 疾病伴随诊断方面开发了一系列试剂盒,并积极推进注册临床试验;领航基因聚焦在血流 (脓毒症)及呼吸道 领域,相继推出了多款病原菌检测试剂盒;锐讯生物聚焦于检测,2020年其产品获得FDA紧急授权。除此之外,在公共卫生领域,国产数字PCR企业针对食源性致病菌、鼠疫、虫媒病毒等,也推出多种检测试剂盒。Drop-off数字PCR检测方法的**主要优势是能够能够在一个反应中检测到基因组序列范围短的同源基因突变。华南地区臻准数字PCR生命科学用品

数字PCR技术流分类目前,dPCR的基本方法都已经建立,根据反应单元的不同形式,主要可分为微板式、微腔式和和微滴式三大类系统。微液滴制备的方法,目前主流的有四种:1)芯片微孔物理分割法,俗称物理分隔法,公司有Fluidgm,Qiagen,Roche,ThermoFisher,;2)液滴分割法,俗称油包水,代替公司有Bio-Rad;3)杂交式芯片液滴法,公司有Stilla;4)注射振动制滴法。PS:芯片式物理分割技术所有已经过期,目前有不少公司在这个技术的基础上进行开发,例如罗氏。华南地区臻准数字PCR生命科学用品dPCR在转基因检测方面的应用仍处于研究和探索的阶段。

dPCR在使用过程中需要特别注意体积误差造成的结果偏差。体积误差对于测量拷贝数浓度会产生偏差。目前dPCR中体积优化方法以光学显微镜观测为主。分散体积的差异会增加拷贝数结果的不确定性,Emslie等使用光学显微镜纵向拍照比较图片边缘的微小差异,考察了数字PCR系统中每个微孔内和孔与孔间的体积差异对实验结果的影响程度。Corbisier等使用微滴数字PCR对6种不同质量分数棉籽粉质粒DNA标准物质[ERM-AD623a-f,浓度范围(10~10)copies/ul]进行分析,优化了液滴体积得到相应校正因子,并使用该校正因子发现并校准了运行软件中液滴体积不变的假设而引起的数据偏离,数据结果的一致性有明显提高。

目前全球数字PCR的市场规模约1.5亿-2.5亿美元,约占荧光定量PCR市场规模(约20亿美元)的10%,但增长趋势明显,有望逐步替代荧光定量PCR技术。目前国际市场有伯乐、赛默飞、凯杰、Stilla、罗氏等主要数字PCR玩家。根据MordorIntelliaence研究报告预测,2019-2024年全球qPCR和dPCR市场将以8.8%的年复合增长率增长,从2014年的41.13亿美元增长到2024年的62.7亿美元。其中,dPCR的增速更快达11.9%,将从2014年的4.75亿美元,增长到2024年8.34亿美元,为PCR检测带来极大的市场。但其预测的发展趋势仍有参考价值。数字PCR在检测珍贵样品和样品核酸存在降解时具有明显的优势。

在定量PCR时,我们常常纠结一个问题,究竟是相对定量还是***定量呢?如今,你无需纠结了,因为数字PCR(digitalPCR)来了。尽管这两种技术有些类似,都是估计起始样品中的核酸量,但它们有一个重要的区别。定量PCR是依靠标准曲线或参照基因来测定核酸量,而数字PCR则让你能够直接数出DNA分子的个数,是对起始样品的***定量。因此特别适用于依靠Ct值不能很好分辨的应用领域:拷贝数变异、突变检测、基因相对表达研究(如等位基因不平衡表达)、二代测序结果验证、miRNA表达分析、单细胞基因表达分析等。三重ddPCR检测体系存在的问题:不同位点检测体系之间的cross-reactivity。上海锐讯数字PCR市场前景

数字PCR即Digital PCR(dPCR),它是一种核酸分子定量技术。华南地区臻准数字PCR生命科学用品

Drop-off实验包括两个针对相同扩增子的TaqMan探针:与野生型序列互补而与突变位点不发生互补的Drop-off探针和与突变型和野生型基因都互补的Reference探针(如图1A)。在野生型等位基因的存在下,Drop-off探针和Reference探针都将与目标杂交,产生双重阳性信号(如图1B,蓝色群)。相反,如果存在突变的等位基因,即使一个核苷酸的突变也会阻止Drop-off探针与之杂交,因此只有Reference探针对目标基因进行退火,从而得到一个阳性信号。华南地区臻准数字PCR生命科学用品

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