华南地区一体化数字PCR原理

对于检测需要高灵敏度以及技术确认的情况下，数字PCR技术也可以发挥重要作用。技术数据表明，数字PCR技术对的比较低检测下限可到2copies/ml，比qPCR灵敏度提升了100倍。经测试，数字PCR在检测和诊断的某些方面优于金标准qPCR，尤其是在低病毒载量样本中，相比起qPCR，数字PCR特异性、灵敏度、重现性和检测限受影响更小。因此，未来预计数字PCR技术也将在类疾病中得到更加广的应用。数字PCR的应用甚广，除了可应用于进行突变的检测以外，也可运用于基因扩增的检测。通过数字PCR技术可建立多重荧光体系，用于同时检测比如非小细胞肺中常见的MET和HER2耐药扩增。有研究报道，使用数字PCR技术对436例非小细胞肺样品进行检测，并挑选样本验证了数字PCR与RNA fish的检测一致性。结果表明，该数字PCR技术在保证了基因扩增检测准确性的同时，还节约了检测时间。三重ddPCR检测体系存在的问题：不同位点检测体系之间的cross-reactivity。华南地区一体化数字PCR原理

引物设计（DesignPrimers）：引物长度（PrimerLength）：18-25个碱基之间。短的引物更易于同靶序列结合，但过短的引物也更可能同基因组上的多个区域相结合而产生非特异性扩增产物。更长的引物会提高同靶序列结合的特异性，但过长的引物（>30bp）同靶序列结合速度变慢，降低结合率。引物长度和组成直接影响引物Tm值（PrimerMeltingTemperature）和退火温度（AnnealingTemperatures）。引物的组成——GC%含量（GCContent）：指引物总碱基中G和C碱基数量的百分比，该值应在40-60%之间。如果模板序列的GC含量较高，推荐使用较高Tm值的引物。深圳双螺旋生物仪器数字PCR试剂盒数字以灵敏度和准确度测量突变的变异程度、检测稀有的DNA靶拷贝以及解析拷贝数变
异状态。

数字PCR实验步骤包括：1）试剂配制：将10xdPCRBuffer、dPCR酶、引物和探针、无核酸酶水混合成dPCR预混液，并分装到8联排管中或96孔板中；将各待测样本的核酸模板、阳性对照、阴性对照分别加入相应的8联排管中或96孔板中；2）芯片进样：在小海龟BioDigital·青全自动样品处理系统上进行芯片上反应液进样和液滴生成；3）芯片扩增：在小海龟BioDigital·青PCR扩增仪上进行芯片上PCR扩增反应；4）芯片阅读：在小海龟BioDigital·青生物芯片阅读仪上进行芯片上荧光信号阅读；5）数据分析：使用生物芯片数据分析·青软件进行数据分析和报告导出；

数字PCR技术流分类目前，dPCR的基本方法都已经建立，根据反应单元的不同形式，主要可分为微板式、微腔式和和微滴式三大类系统。微液滴制备的方法，目前主流的有四种：1）芯片微孔物理分割法，俗称物理分隔法，公司有Fluidgm，Qiagen，Roche，ThermoFisher，;2）液滴分割法，俗称油包水，代替公司有Bio-Rad;3）杂交式芯片液滴法，公司有Stilla;4）注射振动制滴法。PS：芯片式物理分割技术所有已经过期，目前有不少公司在这个技术的基础上进行开发，例如罗氏。dPCR可直接溯源SI国际单位制摩尔，适合单一、双重及多重转基因标准物质研究，一次可识别不同的转基因区域。

数字PCR的引物和探针设计规则同荧光定量PCR是类似的，具体规则如下：1、查找和选择目标序列设计引物和探针的第一步是得到感兴趣基因的核酸序列。找到基因保守区域：基因的保守区域是指来自同一属/种/亚型的、在某个基因上碱基序列差别很小或没有差别的区域。根据需要，使用ClustalX或ClustalW等软件对齐属于同一属/种/亚型的基因的一组序列，在对齐序列的保守区域设计引物，并确保引物结合位点处的保守序列与其它非待检测的属/种/亚型的碱基序列具有较大的差异。扩增产物长度（AmpliconLength）：可在75-200bp之间（产物长度=下游引物位置-上游引物位置+1）。检测结果部分为阳性，部分为阴性，之后进行分子数统计，不需做标曲。珠三角进口数字PCR试剂盒

dPCR的结果统计方式有2种，一种是采用标记多种颜色，另一种采用概率统计的数据处理方法。华南地区一体化数字PCR原理

数字PCR系统通过其独特的微流体阵列式芯片板（MAP）技术，提供强大而易于使用的数字PCR体验。这种专有技术可实现对样品进行一致的自动腔室化，可将一份样品腔室化至20,000个微反应室，其变异系数（CV）达到比较好的<1%。与其它数字PCR系统不同，MAP技术不使用乳液或其它基于液滴的方法对反应进行腔室化。而是利用分配通道将试剂递送至微反应室，具有高精密度和一致性。此外，QuantStudioAbsoluteQ系统可分析加载样品的95%以上，确保获得高度准确的数字PCR结果。华南地区一体化数字PCR原理

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