德国国产数字PCR系统
数字PCR系统通过其独特的微流体阵列式芯片板(MAP)技术,提供强大而易于使用的数字PCR体验。这种专有技术可实现对样品进行一致的自动腔室化,可将一份样品腔室化至20,000个微反应室,其变异系数(CV)达到比较好的<1%。与其它数字PCR系统不同,MAP技术不使用乳液或其它基于液滴的方法对反应进行腔室化。而是利用分配通道将试剂递送至微反应室,具有高精密度和一致性。此外,QuantStudioAbsoluteQ系统可分析加载样品的95%以上,确保获得高度准确的数字PCR结果。通过不同cluster的位置进行突变位点的判断时存在误判的现象。德国国产数字PCR系统
微滴数字PCR主要是将两种互不相溶的液体,以其中一种作为连续相(油),另一种作为分散相(水),在水/油两相表面张力和剪切共同作用下分散相以微小体积单元的形式存在于连续中,从而成液滴。这种液滴式的反应腔室具有体积小、样品间无扩散等优势。在ddPCR中,利用微滴发生器可以一次生成数万乃至百万个纳升甚至皮升级别的单个油包水微滴,作为数字PCR的样品分散载体。这里,液滴中包裹了单拷贝DNA模板和PCR反应液,然后将液滴收集在PCR反应管中进行扩增。PCR反应结束后检测每个微滴的荧光信号。目前Bio-Rad公司的QX100系统、QX200系统均为采用液滴技术的数字PCR系统。图6.Bio-Rad的液滴数字PCR系统苏州进口数字PCR分析应用臻准推出新款数字PCR产品:AccuONE2.0数字PCR系统。
使用ddPCR的一个主要优点在于,定量不是相对的。微滴式数字PCR计算事件的数量,因此可以确定检测极限和比较低起始量,以便达到所需的灵敏度。在连续监控或比较不同患者的效果时,这可以更准确地比较负荷,因为所测得的丰度不是相对的。经过实验证实,ddPCRKRASG12/G13ScreeningKit也能够检测患者cfDNA样品中的KRAS突变(图2)。这些患者的血浆样品购自ConversantBio和ProMedDx,之前已通过FFPE基因分型被分为KRAS突变阳性或阴性。欢迎咨询广州双螺旋科学仪器有限公司。
产物越短,往往扩增效率越高。模板二级结构(Templatesecondarystructure):PCR变性中和变性后的单链DNA不够稳定,容易自发折叠形成二级结构。应避免可形成稳定二级结构的模板链区域,因为如果模板链形成的二级结构在退火温度下稳定存在,定位在模板链二级结构处的引物将无法同模板链相结合。使用mfold可预测引物待结合的区域是否存在复杂的二级结构。设计引物时,尽量使引物定位在模板二级结构以外的序列上。避免具有4个以上相同的连续碱基的区域(Avoid>4repeatsofsamebases):以避免延伸阶段聚合酶“滑动(PolymeraseSlippage)”。选择GC含量(GCContent)在50-60%之间的区域。如果高GC含量区域不可避免,可以尝试提高退火温度,并使用添加剂,例如甘油,PCR本质上是将一个传统的PCR反应分成了数万个PCR反应。
dPCR的测量结果通常表示为含量,即拷贝数值或转基因质量百分比,而QPCR结果通常表示为拷贝数的质量分数。目前市场上可购买到大多数转基因标准物质,以qPCR定值的标准物质是以拷贝数(单倍体基因组当量)的质量分数来表示特性量;以dPCR定值的标准物质直接采用拷贝数比例来表示特性量。不同方法使用不同的表示方式,会造成测量结果不可比。因此质量分数、拷贝数和拷贝数比例之间的关系需要转化,才能得到单位一致,数值可比的数据。EU联合研究中心建议使用转换因子从拷贝数换算到质量分数。在数字PCR赛道,塔歌生物将加速胎儿染色体非整倍体无创产前筛查注册证的申报。上海微滴式数字PCR原理
dPCR的测量结果通常表示为含量,即拷贝数转基因质量百分比,而QPCR结果通常表示为拷贝数的质量分数。德国国产数字PCR系统
数字聚合酶链式反应(digitalpolymerchainreaction,dPCR)技术因具有高灵敏度、受基质干扰少等优势而被广用于转基因食品检测。本研究综述了数字PCR技术的原理、系统各部件的优劣势,梳理了数字PCR技术在转基因检测与溯源技术(标准物质)方面的进展和发展趋势,以期为转基因食品检测领域提供参考依据。dPCR的扩增过程大致上可以分为3步:样品的分散、样品的热循环扩增和样品的检测。对于数字PCR仪器系统,各个部件之间仍然有较大的改进空间,要发挥部件之间的协同作用是很重要的,而且有持续研究的价值。表1中总结了部分常见的数字PCR系统的类型,以及相对在硬件、便携性、性价比和自动化程度上的比较。德国国产数字PCR系统
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