法国臻准数字PCR仪器

时间:2023年02月04日 来源:

数字PCR平台的评价指标有:分割单元数,荧光通道数,操作复杂性和污染风险。但是重要的是检测准确性,评估数字PCR平台的一种方法是使用多个数字PCR平台互相验证,另一种方法是使用定值准确的标准物质。目前的三代的PCR技术各有各的优缺点,也各有各的应用领域,并不是一代取代一代的关系。技术的不断进步给PCR技术注入了新的活力,使其能解锁一个又一个的应用方向,使核酸检测更方便、更准确。目前dPCR仪器的价格仍然十分昂贵,但随着系统加工工艺的改进以及使用较便宜的材料,聚合成更小的体积[556],其价格将会不断的降低,使其应用到更多的检测中。数字PCR是通过将一个样本分成几十到几万份,分配到不同的反应单元,每个单元至少包含一个拷贝的目标分子 。法国臻准数字PCR仪器

微滴数字PCR主要是将两种互不相溶的液体,以其中一种作为连续相(油),另一种作为分散相(水),在水/油两相表面张力和剪切共同作用下分散相以微小体积单元的形式存在于连续中,从而成液滴。这种液滴式的反应腔室具有体积小、样品间无扩散等优势。在ddPCR中,利用微滴发生器可以一次生成数万乃至百万个纳升甚至皮升级别的单个油包水微滴,作为数字PCR的样品分散载体。这里,液滴中包裹了单拷贝DNA模板和PCR反应液,然后将液滴收集在PCR反应管中进行扩增。PCR反应结束后检测每个微滴的荧光信号。目前Bio-Rad公司的QX100系统、QX200系统均为采用液滴技术的数字PCR系统。图6.Bio-Rad的液滴数字PCR系统全自动数字PCR生命科学用品在患者术后复发检测中,数字PCR评估出的ctDNA阳性,可以早于影像学数月提前揭示出患者复发。

PCR(PolymeraseChainReaction)技术,即聚合酶连反应,是一种扩大和复制目的片段DNA的技术,其发现对于生命科学的发展具有重要的意义。而3D数字PCR到底是什么鬼?它其实是出现的一款PCR仪,其具有对目的DNA分子做出定量的优点,进而提供的准确性、灵敏度。应用该技术,实现对DNA进行精确定量,精确度可通过复制次数实现。通过准确性的进行定量检测基因,有助于临床上在、病毒等疾病作参考。同时,其具有高通量,检测速度快,成本相对低等优点,为后期精细奠定基础。

常规PCR和实时荧光PCR定量检测都需要已知拷贝数的标准DNA制定标准曲线,由于样品测定在各种条件上不会完全一致,会造成PCR扩增效率的差异,从而影响定量结果的准确性。而ddPCR不受标准曲线和扩增动力学影响,可以进行定量。如何在双通道设置及双探针标记的情况下实现多重检测?不同位点的双探针检测体系中引物和探针采用不同的终浓度,这样阳性微滴的终点FAM/HEX荧光信号强度就会不同,利用阳性微滴不同的“分簇(cluster)”来区分不同的突变位点。采用对应的KRAS野生型和突变型细胞系对双重ddPCR检测体系的性能进行验证。结果显示除了Q61H位点外,其他位点的检测体系在54C的情况下均能很好的区分4个明显的cluster。数字PCR技术min检测下限可到2copies/ml,比qPCR灵敏度提升了100倍。

引物设计(DesignPrimers):引物长度(PrimerLength):18-25个碱基之间。短的引物更易于同靶序列结合,但过短的引物也更可能同基因组上的多个区域相结合而产生非特异性扩增产物。更长的引物会提高同靶序列结合的特异性,但过长的引物(>30bp)同靶序列结合速度变慢,降低结合率。引物长度和组成直接影响引物Tm值(PrimerMeltingTemperature)和退火温度(AnnealingTemperatures)。引物的组成——GC%含量(GCContent):指引物总碱基中G和C碱基数量的百分比,该值应在40-60%之间。如果模板序列的GC含量较高,推荐使用较高Tm值的引物。全自动数字PCR平台,让数字PCR真正迈入新时代,助推数字PCR普及应用。全自动数字PCR市场前景

数字PCR具有诸多优点,但也存在一定的不足,如成本高、仪器操作复杂、经济效益低等。法国臻准数字PCR仪器

对于检测需要高灵敏度以及技术确认的情况下,数字PCR技术也可以发挥重要作用。技术数据表明,数字PCR技术对的比较低检测下限可到2copies/ml,比qPCR灵敏度提升了100倍。经测试,数字PCR在检测和诊断的某些方面优于金标准qPCR,尤其是在低病毒载量样本中,相比起qPCR,数字PCR特异性、灵敏度、重现性和检测限受影响更小。因此,未来预计数字PCR技术也将在类疾病中得到更加广的应用。数字PCR的应用甚广,除了可应用于进行突变的检测以外,也可运用于基因扩增的检测。通过数字PCR技术可建立多重荧光体系,用于同时检测比如非小细胞肺中常见的MET和HER2耐药扩增。有研究报道,使用数字PCR技术对436例非小细胞肺样品进行检测,并挑选样本验证了数字PCR与RNA fish的检测一致性。结果表明,该数字PCR技术在保证了基因扩增检测准确性的同时,还节约了检测时间。法国臻准数字PCR仪器

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